該研究所由饒平凡教授于1993年牽頭自由組合而成,她承建的“蛋白質與酶工程”學科于1995年就被確認為福建省屬高校首批重點學科，2005年“生物化學與分子生物學”和“食品科學”又被評為省重點學科。已經建成了一個具有承擔重大“產、學、研”項目的能力、較完備實驗設備、高素質人才梯隊和高水平運轉的產學研基地。曾接受過習近平、賈慶林和賀國強等領導同志的親臨檢查和指導。

承擔項目：該團隊近五年來，承擔并完成多項重大項目，其中包括國家科技部“973”項目1項，國家自然科學基金項目5項，省科技廳重大、重點項目等5項，以及多個企業橫向合作研究項目，總經費近600萬元。經過多年的發展，本所圍繞自由基生物學與醫學、蛋白質化學與工程已經具備了鮮明的學科特點。

本團隊近年來又在“中醫、中藥的現代化”的方面形成了基于“美拉德反應產物”和“超分子納米顆粒”兩大高延展性的技術平臺。

創新研究團隊：本團隊以多名留學歸國的中青年科學家為骨干，技術總顧問是饒平凡教授，日本大阪大學生物化學博士，57歲，現任國際食品聯盟前任主席；所長劉樹滔教授，日本廣島大學博士后，45歲；副所長潘劍茹副研究員，博士，38歲，福州大學“學術新人”獲得者；陳曉超講師，英國愛丁堡大學博士，35歲。另外還聘任了一些年齡低于35歲的青年科研人員。

研究設施：在“挖掘功能食品和中醫、中藥的傳統智慧，應用現代科技篩選并工業化制備生物活性分子”的思路指導下，本團隊重點配置體現生物活性（特別是自由基相關的）分子分離、表征和工業化制備領域國際水平的關鍵設備。因此，本團隊已具備了從新藥候選分子的發現和改造，細胞、動物和人體活性鑒定到轉基因發酵生產的軟硬件條件。

近期目標：本團隊的建設將有利于提高我省乃至我國保健食品與中醫、中藥自主研發能力。未來5年內，本團隊將進一步建設自由基生物學與醫學、超分子納米顆粒這兩個研究平臺，一方面開展自由基與經絡的關系、中藥和食品來源的納米顆粒的制備與活性等基礎研究；另一方面分別在基因工程修飾和化學修飾方面對藥物候選分子進行改造和規模制備。