教育工作經歷:
2023年8月-至今:福州大學 | 生物科學與工程學院
2018年9月-2023年6月:上海交通大學 | 系統生物醫學研究院 | 生物學 | 博士
2015年8月-2018年6月:中山大學 | 生命科學學院 | 動物學 | 碩士
2011年9月-2015年6月:福州大學 | 生物科學與工程學院 | 生物工程 | 本科
上海交通大學,生命科學技術學院,訪問學者
教學簡介:
無
科研簡介:
主要研究領域為蛋白質翻譯后修飾的系統生物學研究,包括:
1. 蛋白質翻譯后修飾數據庫。
收集和整理蛋白質翻譯后修飾的實驗數據,提供系統化的信息平臺,支持研究者查詢和分析修飾位點、類型及其功能關聯。
2. 蛋白質翻譯后修飾調控蛋白功能的計算解析。
利用計算方法和數學建模,分析修飾如何調控蛋白質的活性、穩定性、相互作用和信號傳導,從系統層面揭示修飾的生物學功能。
3. 蛋白質翻譯后修飾的人工智能預測方法。
通過機器學習和深度學習等AI技術,預測未知的修飾位點、修飾類型及其功能效應,為修飾研究提供高效的工具和新的研究方向。
目前已在Advanced Science(IF=14.1)、Chemical Engineering Journal (IF=13.2)、
Green Chemistry(IF=9.2)和International Journal of Biological Macromolecules(IF=8.5)等國際知名期刊發表SCI論文24篇(中科院1區11篇,中科院2區8篇);授權2項發明專利和5項計算機軟件著作權。
科研項目:
福建省人社廳高層次人才和青年優秀人才培養資助項目,主持,2024-2025
福州大學新進教師科研啟動基金,主持,2023-2025
福州大學貴重儀器設備開放測試基金,主持,2024-2024
福建省自然科學基金面上項目,參與,2026-2029
社會兼職:
廈門市科技專家庫專家
泉州市科協科技專家庫專家
福州海關特殊物品風險評估專家
Briefings in Bioinformatics期刊評審專家
代表性論文:
1.Hong X, Lv J, Li Z, Zhu J, Li J, Rahman MU, Wei T, Mu J, Chen HF*. Deep learning model of post-translational modification regulating liquid-liquid phase separation. Communications Chemistry, 2025, 8:393.
2.Hong X, Li N, Lv J, Zhang Y, Li J*, Zhang J*, Chen HF*. PTMint database of experimentally verified PTM regulation on protein-protein interaction. Bioinformatics, 2023, 39:btac823
3.Hong X, Song K, Rahman MU, Wei T, Zhang Y, Da LT*, Chen HF*. Phosphorylation Regulation Mechanism of β2 Integrin for the Binding of Filamin Revealed by Markov State Model. Journal of Chemical Information and Modeling, 2023, 63:605-618
4.Hong X, Lv J, Li Z, Xiong Y, Zhang J*, Chen HF*. Sequence-based machine learning method for predicting the effects of phosphorylation on protein-protein interactions. International Journal of Biological Macromolecules, 2023, 243:125233
5.Xu X#, Hong X#, Zeng W, Yan R, Li F, Meng C, Shi X*, Luo J*, Wang G*. Stereoselective synthesis of (S)-3-Hydroxy-3-phenylpropionate with a novel carbonyl reductase identified from a soda lake metagenome. International Journal of Biological Macromolecules, 2026, 335:149193.
6.Luo Y#, Hong X#, Chen X, Liang Y, Li F*, Shi X*, Huang X*, Enhanced brain delivery of oleanolic acid by GSH-PEGylated liposomes and its amelioration of scopolamine-induced cognitive dysfunction via multi-target regulation. International Journal of Pharmaceutics: X, 2026, 11:100509
軟件著作權:
1. 翻譯后修飾調控蛋白互作的數據查詢系統【簡稱:PTMint】
2. 磷酸化修飾調控蛋白互作的人工智能預測系統【簡稱:PhosPPI】
3. 翻譯后修飾調控相分離的數據查詢系統【簡稱:PTMPhaSe】
4. 磷酸化修飾調控相分離的深度學習預測系統【簡稱:PhosLLPS】
5. 變構蛋白構象的增強采樣系統【簡稱:IDPFold】
獲獎情況:
1. 上海交通大學優秀畢業生
2. 碩士研究生國家獎學金
3. 福州大學本科生優秀畢業設計(論文)