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  • 生物科學與工程學院

    College of Biological Science and Engineering

    洪曉昆

    發布日期:2023-08-27 發布者:

    姓名:洪曉昆

    性別:

    職稱:暫無

    學歷:博士研究生

    電子郵件:hongxk@fzu.edu.cn

    研究方向:生物信息學,酶分子工程

    研究生招生專業

    教育工作經歷:

    2023年8月-至今:福州大學 | 生物科學與工程學院

    2018年9月-2023年6月:上海交通大學 |系統生物醫學研究院 | 生物學 | 博士

    2015年8月-2018年6月:中山大學 | 生命科學學院 | 動物學 | 碩士

    2011年9月-2015年6月:福州大學 | 生物科學與工程學院 | 生物工程 | 本科

    教學簡介:

    本科生課程:暫無

    研究生課程:暫無

    科研簡介:

    針對醫藥、化工等行業中具有重要應用前景的藥物,基于計算生物學、人工智能和結構生物學的方法,對關鍵酶分子進行理性設計,并進行分子改造,以期提高酶立體/化學選擇性、藥物產量以及減少副產物等。

    主持科研項目:

    暫無

    代表性論文:

    1. Hong X, Li N, Lv J, Zhang Y, Li J*, Zhang J*, Chen HF*. PTMint database of experimentally verified PTM regulation on protein-protein interaction. Bioinformatics. 2023 Jan 1;39(1):btac823. (JCR 1)

    2. Hong X, Song K, Rahman MU, Wei T, Zhang Y, Da LT*, Chen HF*. Phosphorylation Regulation Mechanism of β2 Integrin for the Binding of Filamin Revealed by Markov State Model. J Chem Inf Model. 2023 Jan 23;63(2):605-618. (JCR 1)

    3. Hong X, Lv J, Li Z, Xiong Y, Zhang J*, Chen HF*. Sequence-based machine learning method for predicting the effects of phosphorylation on protein-protein interactions. Int J Biol Macromol. 2023 Jul 15;243:125233. (JCR 1)

    4. Hong X#, Liu X#, Su B*, Lin J*. Improved Antimicrobial Activity of Bovine Lactoferrin Peptide (LFcinB) Based on Rational Design. Protein J. 2023 Aug 11 (JCR 3)

    5. Hong XK#, Zhang X#, Fusco OA, Lan YG, Lun ZR*, Lai DH*. PCR-based identification of Trypanosoma lewisi and Trypanosoma musculi using maxicircle kinetoplast DNA. Acta Trop. 2017 Jul;171:207-212. (JCR 2)

    6. Li W#, Wang D#, Hong X, Shi J, Hong J, Su S, Loaiciga CR, Li J, Liang W, Shi J*, Zhang D. Identification and validation of new MADS-box homologous genes in 3010 rice pan-genome. Plant Cell Rep. 2023 Jun;42(6):975-988. (JCR 1)

    7. Li X, Xu Z, Hong X, Zhang Y*, Zou X*. Databases and Bioinformatic Tools for Glycobiology and Glycoproteomics. Int J Mol Sci. 2020 Sep 14;21(18):6727. (JCR 1)

    8. Zhang X, Hong XK, Li SJ, Lai DH, Hide G, Lun ZR*, Wen YZ*. The effect of normal human serum on the mouse trypanosome Trypanosoma musculi in vitro and in vivo. Exp Parasitol. 2018 Jan;184:115-120. (JCR 3)

    9. Lai DH, Hong XK, Su BX, Liang C, Hide G, Zhang X, Yu X, Lun ZR*. Current status of Clonorchis sinensis and clonorchiasis in China. Trans R Soc Trop Med Hyg. 2016 Jan;110(1):21-7. (JCR 3)


    授權專利情況

    1. 賴德華,洪曉昆,張玄,溫硯子,倫照榮。一種檢測路氏錐蟲的引物對和試劑盒。ZL 2017 1 0081801.9

    2. 賴德華,洪曉昆,張玄,溫硯子,倫照榮。一種檢測小鼠錐蟲的引物對和試劑盒。ZL 2017 1 0081625.9


    授權軟件著作權情況

    1. 陳海峰,洪曉昆。翻譯后修飾調控蛋白互作的數據查詢系統【簡稱:PTMint】。2022SR1528851

    2. 陳海峰,洪曉昆。磷酸化修飾調控蛋白互作的人工智能預測系統【簡稱:PhosPPI】。2023SR0399360

    獲獎情況:

    1. 上海交通大學優秀畢業生 (2023)

    2. 碩士研究生國家獎學金 (2017)

    3. 有害生物控制與資源利用國家重點實驗室“杰出研究生獎”(2017)

    4. 有害生物控制與資源利用國家重點實驗室“優秀研究生獎”(2016)

    5. 福州大學本科生優秀畢業設計(論文)(2015)

    其他


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